คณะรัฐมนตรีมีมติ ดังนี้
               ๑. เห็นชอบในหลักการของความร่วมมือทางวิชาการในโครงการสาธิตการผลิตเอทานอลจากกากมันสำปะหลังในประเทศไทย ระหว่างสำนักงานปลัดกระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีกับผู้แทนองค์การพลังงานใหม่และเทคโนโลยีอุตสาหกรรม (New Energy and Industrial Technology Development Organization ; NEDO) ประเทศญี่ปุ่น และการให้ปลัดกระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีเป็นผู้ลงนามกับผู้แทนองค์การ NEDO ประเทศญี่ปุ่น และให้กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีรับความเห็นของสำนักงานคณะกรรมการกฤษฎีกาเกี่ยวกับกรณีการขอยกเว้นการขึ้นทะเบียนครุภัณฑ์ตามระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรี ว่าด้วยการพัสดุ พ.ศ. ๒๕๓๕ ซึ่งข้อ ๑๒ (๑) และ (๒) แห่งระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรี ว่าด้วยการพัสดุฯ กำหนดให้คณะกรรมการว่าด้วยการพัสดุมีอำนาจหน้าที่ตีความและวินิจฉัยปัญหาเกี่ยวกับการปฏิบัติตามระเบียบ และพิจารณาอนุมัติยกเว้นหรือผ่อนผันการไม่ปฏิบัติตามระเบียบ จึงเป็นการกำหนดให้มีองค์การเฉพาะเพื่อทำหน้าที่พิจารณาและวินิจฉัยเกี่ยวกับการปฏิบัติตามระเบียบเพื่อเป็นการแก้ไขปัญหาหรือระงับข้อพิพาทที่ส่วนราชการทั้งหลายดำเนินการตามระเบียบไม่เป็นไปในแนวทางเดียวกัน และสามารถยกเว้นหรือผ่อนผันการดำเนินการบางเรื่องที่ส่วนราชการติดขัดหรือปฏิบัติไม่ถูกต้องได้ ดังนั้น คณะรัฐมนตรีจึงไม่มีอำนาจยกเว้นหรือผ่อนผันการไม่ปฏิบัติตามระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรี ว่าด้วยการพัสดุฯ รวมทั้งให้รับความเห็นและข้อสังเกตของกระทรวงการคลังและกระทรวงการต่างประเทศเกี่ยวกับคำว่า “คู่สัญญา” ที่กำหนดไว้ในบันทึกความเข้าใจฯ ควรจะเป็นคู่สัญญาระหว่างสำนักงานปลัดกระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีกับ NEDO เท่านั้น ไม่ควรมีชื่อสำนักงานนวัตกรรมแห่งชาติ (องค์การมหาชน) เข้ามาร่วมเกี่ยวข้องและปรากฏอยู่ในแต่ละข้อสัญญา และในการดำเนินโครงการฯ ควรให้ความสำคัญกับการมีส่วนร่วมของตัวแทนจากโรงงานอุตสาหกรรมในกลุ่มวิสาหกิจขนาดกลางและขนาดย่อม (Small and Medium Enterprises : SMEs) ซึ่งมีศักยภาพ ไปพิจารณาดำเนินการ แล้วให้นำร่างบันทึกความเข้าใจฯ เสนอคณะรัฐมนตรีอีกครั้งหนึ่งก่อนดำเนินการต่อไป
               ๒. เรื่องการขอยกเว้นภาษีอากรทุกชนิดในการนำเครื่องจักร อุปกรณ์ และวัสดุต่าง ๆ ที่ NEDO นำเข้ามาใช้ในโครงการและการขอรับยกเว้นภาษีอากรเมื่อโอนกรรมสิทธิ์ ให้บริษัท เอี่ยมบูรพา เอทานอล จำกัด ซึ่งเป็นบริษัทเอกชนที่ได้รับคัดเลือกเข้าร่วมโครงการฯ ให้กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีและหน่วยงานที่เกี่ยวข้องประสานกับกระทรวงการคลังเพื่อดำเนินการให้ถูกต้องเป็นไปตามข้อกฎหมายและระเบียบที่เกี่ยวข้อง
               ๓. เรื่องการขอให้ได้รับยกเว้นการขึ้นทะเบียนครุภัณฑ์นั้น เป็นอำนาจของคณะกรรมการว่าด้วยการพัสดุที่จะพิจารณาอนุญาต จึงให้กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีรับไปขอยกเว้นการขึ้นทะเบียนครุภัณฑ์ดังกล่าวต่อคณะกรรมการว่าด้วยการพัสดุตามนัยระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรีว่าด้วยการพัสดุ พ.ศ. ๒๕๓๕ ต่อไป
               ๔. ส่วนค่าใช้จ่ายที่จะเกิดขึ้นจากการบริหารจัดการโครงการฯ ให้ใช้จ่ายจากงบประมาณรายจ่ายประจำปีที่ได้รับการจัดสรรไว้ของสำนักงานนวัตกรรมแห่งชาติ (องค์การมหาชน) ตามความเห็นของสำนักงบประมาณ