ในคราวประชุมคณะรัฐมนตรี นายกรัฐมนตรีมีข้อสั่งการด้านการบริหารราชการแผ่นดินและอื่น ๆ ดังนี้
               ๑. มอบหมายให้รองนายกรัฐมนตรี (พลอากาศเอก ประจิน จั่นตอง) ร่วมกับทุกส่วนราชการที่เกี่ยวข้องนำข้อมูลจากการประชุมสัมมนา เรื่อง การขับเคลื่อนและปฏิรูปประเทศไทยแบบบูรณาการ เมื่อวันที่ ๒๓ พฤษภาคม ๒๕๕๙ และข้อมูลอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องมาจัดทำเป็นเอกสารสรุปผลการขับเคลื่อนและปฏิรูปประเทศในช่วงที่ผ่านมาของรัฐบาล (ตั้งแต่วันที่ ๒๒ พฤษภาคม ๒๕๕๗-มิถุนายน ๒๕๕๙) โดยจำแนกเป็น ๖ กลุ่มงานตามกลุ่มการบริหารราชการแผ่นดิน โดยเฉพาะผลงานที่มีผลโดยตรงต่อประชาชนหรือผลงานที่เป็นความคาดหวังของประชาชน
               ๒. ให้กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีเป็นหน่วยงานหลักร่วมกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องดำเนินการ (๑) เร่งสร้างแรงจูงใจให้มีการคิดค้นสร้างสรรค์นวัตกรรมอย่างต่อเนื่อง เช่น ให้ทุนแก่นักเรียน นักศึกษารุ่นใหม่ที่มีศักยภาพในการคิดค้นสร้างสรรค์นวัตกรรม นำนวัตกรรมที่สร้างสรรค์ไปสร้างรายได้ให้แก่ผู้คิดค้น (๒) พิจารณานำนวัตกรรมที่มีอยู่ไปต่อยอดใช้ประโยชน์ในภาคส่วนต่าง ๆ ให้เกิดผลเป็นรูปธรรม เช่น ร่วมกับกระทรวงสาธารณสุขในการนำแว่นตาสำหรับคนตาบอดหรืออวัยวะเทียมไปให้คนพิการได้ใช้ประโยชน์ และ (๓) ดำเนินการร่วมกับกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ กระทรวงอุตสาหกรรม กระทรวงมหาดไทย และหน่วยงานที่เกี่ยวข้องพิจารณากำหนดทิศทางการสร้างสรรค์นวัตกรรมให้สอดรับกับการนำไปใช้ประโยชน์ในภาคการเกษตร ภาคอุตสาหกรรม หรือภาคส่วนอื่น ๆ เช่น รถหรือเครื่องบินบังคับวิทยุสำหรับฉีดปุ๋ย รถหรือเรือสำหรับดูดเลนในแม่น้ำลำคลอง
               ๓. ให้กระทรวงเทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสารเป็นหน่วยงานหลักร่วมกับกระทรวงมหาดไทย กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ และหน่วยงานที่มีศูนย์บริการประชาชนในชุมชนบูรณาการการทำงานของศูนย์บริการดังกล่าวเพื่อให้มีการเชื่อมโยงข้อมูลระหว่างกัน ทำงานอย่างมีเอกภาพ และเกิดประโยชน์สูงสุดต่อประชาชนในชุมชน
               ๔. มอบหมายให้รองนายกรัฐมนตรี (พลเอก ธนะศักดิ์ ปฏิมาประกร) ร่วมกับกระทรวงการท่องเที่ยวและกีฬาและกระทรวงศึกษาธิการพิจารณาความเหมาะสมในการยกฐานะสถาบันการพลศึกษาเป็นมหาวิทยาลัยการกีฬาแห่งชาติขึ้น เพื่อเป็นมหาวิทยาลัยเฉพาะทางที่รองรับในด้านวิชาการทางด้านการกีฬา มีมาตรฐานหลักสูตรด้านกีฬา ผลิตนักกีฬาและบุคลากรทางการกีฬาให้มีคุณภาพ และนำเสนอคณะรัฐมนตรีต่อไป รวมทั้งให้กระทรวงการท่องเที่ยวและกีฬาให้การสนับสนุนนักกีฬาสมัครเล่นหรือนักกีฬาอาชีพที่สร้างชื่อเสียงให้แก่ประเทศชาติ เช่น การสนับสนุนเงินรางวัลเพื่อสร้างขวัญและกำลังใจให้แก่นักกีฬาต่อไป
               ๕. ให้กระทรวงมหาดไทยเป็นหน่วยงานหลักร่วมกับส่วนราชการที่เกี่ยวข้อง เช่น กระทรวงการพัฒนาสังคมและความมั่นคงของมนุษย์ และกระทรวงศึกษาธิการ พิจารณากำหนดมาตรการทั้งในเชิงป้องกันและแก้ไขปัญหาอัคคีภัยเพิ่มเติม เช่น การกำหนดมาตรฐานอาคาร การซักซ้อมเมื่อเผชิญเหตุ กรอบการคุ้มครองประกันอัคคีภัย การเคลื่อนย้ายผู้ประสบเหตุ ทั้งนี้ ให้คำนึงถึงความเหมาะสมของแต่ละสถานที่ เช่น ส่วนราชการ โรงเรียนและหอพัก รวมทั้งให้ทุกส่วนราชการดำเนินมาตรการดังกล่าวอย่างเคร่งครัด
               ๖. ให้กระทรวงการพัฒนาสังคมและความมั่นคงของมนุษย์เร่งรัดการดำเนินการตามมติคณะรัฐมนตรีเมื่อวันที่ ๓ พฤษภาคม ๒๕๕๙ (เรื่อง การขับเคลื่อนโครงการฟื้นฟูเมืองชุมชนดินแดง) ที่ให้กระทรวงการพัฒนาสังคมและความมั่นคงของมนุษย์เป็นหน่วยงานหลักร่วมกับกระทรวงมหาดไทยและหน่วยงานที่เกี่ยวข้องพิจารณาดำเนินการแก้ไขปัญหาและพัฒนาที่อยู่อาศัยของชุมชนในพื้นที่ที่มีสภาพทรุดโทรมและไม่เหมาะสม เช่น ชุมชนป้อมมหากาฬ ให้เกิดผลเป็นรูปธรรมโดยเร็ว
               ๗. ให้กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมเป็นหน่วยงานหลักร่วมกับกระทรวงมหาดไทย และหน่วยงานที่เกี่ยวข้องพิจารณากำหนดมาตรการในการกำจัดขยะมูลฝอยให้สอดคล้องกับแนวทางประชารัฐ เช่น การให้ภาคเอกชนเข้ามาร่วมดำเนินการจัดการขยะมูลฝอยกับภาครัฐ การจัดเก็บค่าจัดการขยะมูลฝอยให้สอดคล้องกับปริมาณขยะ
               ๘. ให้กระทรวงการคลังปรับปรุงกรรมการผู้ทรงคุณวุฒิในคณะกรรมการต่าง ๆ ให้สอดคล้องกับคณะกรรมการสานพลังประชารัฐและคณะทำงาน ๑๒ คณะภาคธุรกิจ เพื่อให้เกิดความต่อเนื่องในการขับเคลื่อนนโยบายในการปฏิรูปของรัฐบาลและคณะรักษาความสงบแห่งชาติ