คณะรัฐมนตรีมีมติ ดังนี้
               ๑. รับทราบมติคณะกรรมการนโยบายน้ำและอุทกภัยแห่งชาติ (กนอช.) ในการประชุมครั้งที่ ๒/๒๕๕๕ เมื่อวันที่ ๒ พฤษภาคม ๒๕๕๕ ที่เห็นชอบว่า ในกรณีที่คณะกรรมการบริหารจัดการน้ำและอุทกภัย (กบอ.) พิจารณากลั่นกรองรายละเอียดของโครงการตามแนวทางที่ กนอช. และคณะกรรมการยุทธศาสตร์เพื่อวางระบบการบริหารจัดการทรัพยากรน้ำ (กยน.) กำหนดไว้แล้ว ให้ กบอ. สามารถเสนอแผนงานโครงการดังกล่าวต่อคณะรัฐมนตรีเพื่อพิจารณาอนุมัติได้โดยตรง และให้ กบอ. นำเสนอ กนอช. เพื่อทราบต่อไป ทั้งนี้ ให้ กบอ. เร่งจัดทำแผนปฏิบัติการบริหารจัดการน้ำการป้องกันและแก้ไขปัญหาอุทกภัยแห่งชาติเสนอต่อ กนอช. และคณะรัฐมนตรีเพื่อพิจารณาโดยเร็ว เพื่อให้การพิจารณาอนุมัติแผนงาน/โครงการของ กบอ. มีทิศทางที่ชัดเจน สอดคล้องกับแผนแม่บทการบริหารจัดการทรัพยากรน้ำ และเป็นไปตามนโยบายที่ กนอช. กำหนด รวมทั้งให้ กบอ. เร่งดำเนินการเสนอขอแก้ไขระเบียบสำนักนายกรัฐมนตรี ว่าด้วยการบริหารจัดการน้ำและอุทกภัยแห่งชาติ พ.ศ. ๒๕๕๕ ต่อไป ตามความเห็นของสำนักงาน
คณะกรรมการพัฒนาการเศรษฐกิจและสังคมแห่งชาติ
               ๒. รับทราบ อนุมัติ และเห็นชอบ ตามที่รัฐมนตรีว่าการกระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี ประธานกรรมการบริหารจัดการน้ำและอุทกภัยเสนอ ดังนี้
                   ๒.๑ รับทราบสรุปรายงานสถานการณ์น้ำของประเทศไทย และความคืบหน้าการดำเนินงานตามแผนการป้องกันบรรเทาอุทกภัย
                   ๒.๒ อนุมัติให้ยกเว้นการดำเนินการตามมติคณะรัฐมนตรีเมื่อวันที่ ๒๔ เมษายน ๒๕๕๕ ในการพิจารณาข้อเสนอแผนการพัฒนาประสิทธิภาพการเก็บและการระบายน้ำในพื้นที่รับน้ำนองในพื้นที่ ๑๑ จังหวัด เพื่อดำเนินการโครงสร้างพื้นฐานในระยะเร่งด่วน ของกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ กระทรวงมหาดไทย และกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม และข้อเสนอของกระทรวงอุตสาหกรรม
                   ๒.๓ อนุมัติงบประมาณการดำเนินงานตามข้อเสนอแผนการพัฒนาประสิทธิภาพการเก็บและการระบายน้ำในพื้นที่รับน้ำนองในพื้นที่ ๑๑ จังหวัด เพื่อดำเนินการโครงสร้างพื้นฐานในระยะเร่งด่วน ของกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ กระทรวงมหาดไทย และกระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม จำนวน ๙๖ รายการ วงเงินงบประมาณ ๖๑๔,๑๓๖,๒๐๐ บาท โดยใช้เงินตามพระราชกำหนดให้อำนาจกระทรวงการคลังกู้เงินเพื่อการวางระบบการบริหารจัดการน้ำและสร้างอนาคตประเทศ พ.ศ. ๒๕๕๕ (เงินกู้ ๓๕๐,๐๐๐ ล้านบาท)
                   ๒.๔ อนุมัติงบประมาณการดำเนินงานตามข้อเสนอของกระทรวงอุตสาหกรรม วงเงินงบประมาณ ๓,๒๓๖,๖๙๔,๐๐๐ บาท โดยใช้เงินตามพระราชกำหนดให้อำนาจกระทรวงการคลังกู้เงินเพื่อการวางระบบการบริหารจัดการน้ำและสร้างอนาคตประเทศ พ.ศ. ๒๕๕๕ (เงินกู้ ๓๕๐,๐๐๐ ล้านบาท)
                   ๒.๕ เห็นชอบข้อเสนอการบริหารจัดการสิ่งก่อสร้างรุกล้ำลำน้ำสาธารณะ ตามที่ กบอ. เสนอ และให้หน่วยงานที่เกี่ยวข้อง ได้แก่ กระทรวงมหาดไทย กระทรวงการพัฒนาสังคมและความมั่นคงของมนุษย์ กรุงเทพมหานคร รับไปดำเนินการ 
               ๓. สำหรับวงเงินอุดหนุนการดำเนินโครงการปรับปรุงระบบเขื่อนป้องกันอุทกภัยนิคม/สวน/เขตอุตสาหกรรม ๖ แห่ง ได้แก่ นิคมอุตสาหกรรมบางปะอิน สวนอุตสาหกรรมบางกะดี เขตประกอบการอุตสาหกรรมโรจนะ นิคมอุตสาหกรรมไฮเทค สวนอุตสาหกรรมนวนคร และนิคมอุตสาหกรรมสหรัตนนคร ตามข้อเสนอของกระทรวงอุตสาหกรรม ให้เป็นไปตามการคำนวณราคาตามแบบมาตรฐานของการนิคมอุตสาหกรรมแห่งประเทศไทยที่ กบอ. ได้พิจารณาเห็นชอบแล้ว ในวงเงิน ๓,๒๓๖,๖๙๔,๐๐๐ บาท ทั้งนี้ ให้หน่วยงานเจ้าของโครงการและหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง เช่น กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ กระทรวงมหาดไทย กระทรวงทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม กระทรวงการพัฒนาสังคมและความมั่นคงของมนุษย์ และกระทรวงอุตสาหกรรม เป็นต้น ขอตกลงในรายละเอียดกับสำนักงบประมาณก่อนดำเนินการต่อไป รวมทั้งให้รับความเห็นของกระทรวงการคลังและสำนักงานคณะกรรมการพัฒนาการเศรษฐกิจและสังคมแห่งชาติเกี่ยวกับการดำเนินโครงการที่ควรคำนึงถึงความซ้ำซ้อนในการขอรับงบประมาณ และให้หน่วยงานที่เกี่ยวข้องเร่งรัด กำกับ ติดตามการดำเนินโครงการให้แล้วเสร็จโดยเร็ว รวมถึงการคำนึงถึงมาตรฐานการออกแบบระบบเขื่อนที่สอดคล้องกับสภาพภูมิประเทศ และควรให้หน่วยงานที่เกี่ยวข้องทำความเข้าใจกับชุมชนโดยรอบนิคมให้เห็นถึงความจำเป็นที่ภาครัฐได้ให้ความสำคัญในการลงทุนเพื่อปกป้องนิคมอุตสาหกรรมต่างๆ ซึ่งถือเป็นพื้นที่เศรษฐกิจสำคัญ ไปพิจารณาดำเนินการในส่วนที่เกี่ยวข้องด้วย
               ๔. ให้ กบอ. รับไปประสานงานและหารือในรายละเอียดกับกระทรวงเกษตรและสหกรณ์ กระทรวงการพัฒนาสังคมและความมั่นคงของมนุษย์ กระทรวงมหาดไทย และผู้ว่าราชการจังหวัดที่เกี่ยวข้องกับพื้นที่รับน้ำนองในพื้นที่ ๑๑ จังหวัด เพื่อจัดทำแผนเผชิญเหตุและกำหนดแนวทางการปฏิบัติต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องร่วมกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งการเตรียมความพร้อมเพื่อรองรับการอพยพ การจัดเตรียมพื้นที่และสิ่งอำนวยความสะดวกในศูนย์พักพิง การแก้ไขปัญหาการรุกล้ำที่รับน้ำและทางระบายน้ำ และการป้องกันไม่ให้มีการรุกล้ำพื้นที่เพิ่มเติม และให้มีการซักซ้อมประชาสัมพันธ์ให้ประชาชนในพื้นที่ทราบข้อมูลต่าง ๆ อย่างทั่วถึงกันเป็นการล่วงหน้าด้วย