คณะรัฐมนตรีมีมติรับทราบตามที่สำนักเลขาธิการคณะรัฐมนตรีเสนอคำพิพากษาศาลปกครองกลางยกฟ้องในคดีระหว่างนายอนุชา โมกขะเวส ฟ้องคณะรัฐมนตรีกับพวกรวม ๓ คน ต่อศาลปกครองกลาง ขอให้เพิกถอนมติคณะรัฐมนตรีในส่วนที่เห็นชอบให้นายมานิต วัฒนเสน เลื่อนขึ้นดำรงตำแหน่งปลัดกระทรวงมหาดไทย และขอให้เพิกถอนคำวินิจฉัยของคณะกรรมการพิทักษ์ระบบคุณธรรม โดยเห็นว่า
               ๑. ในการดำเนินการแต่งตั้งปลัดกระทรวงมหาดไทยที่พิพาทนี้ ผู้ถูกฟ้องคดีที่ ๑ (คณะรัฐมนตรี) และที่ ๒ (รัฐมนตรีว่าการกระทรวงมหาดไทย) ได้ดำเนินการตามขั้นตอนและวิธีการที่กฎหมายกำหนดครบถ้วนแล้ว โดยผู้ถูกฟ้องคดีที่ ๒ ได้คำนึงถึงความรู้ ความสามารถ ความประพฤติ และผลงาน ตามหลักเกณฑ์ที่กฎหมายบัญญัติ ซึ่งอยู่ในดุลพินิจของผู้ถูกฟ้องคดีที่ ๒ ที่สามารถกระทำได้ และไม่ถือว่าเป็นการใช้ดุลพินิจที่ไม่ชอบด้วยกฎหมายแต่อย่างใด
               ๒. ไม่มีพยานหลักฐานใด ๆ ที่ระบุได้อย่างแจ้งชัดว่า นายมานิต วัฒนเสน มีพฤติการณ์ไปในทางอิงแอบกับผลประโยชน์ของพรรคการเมืองโดยไม่สุจริตตามที่ผู้ฟ้องคดีกล่าวอ้าง
               ๓. การดำเนินการเสนอรายชื่อผู้ที่เหมาะสมที่จะได้รับการแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งปลัดกระทรวงมหาดไทย โดยปลัดกระทรวงมหาดไทยในขณะนั้น เป็นไปตามข้อกำหนดในหนังสือสำนักงาน ก.พ.
               ๔. เมื่อได้วินิจฉัยแล้วว่า การพิจารณาคัดเลือกผู้ที่เหมาะสมสมควรได้รับการแต่งตั้งให้ดำรงตำแหน่งปลัดกระทรวงมหาดไทยของผู้ถูกฟ้องคดีที่ ๒ นั้นชอบด้วยกฎหมาย ดังนั้น การที่ผู้ถูกฟ้องคดีที่ ๑ มีมติคณะรัฐมนตรีเมื่อวันที่ ๑๘ สิงหาคม ๒๕๕๒ เห็นชอบให้แต่งตั้งนายมานิต วัฒนเสน ดำรงตำแหน่งปลัดกระทรวงมหาดไทยตามที่ผู้ถูกฟ้องคดีที่ ๒ เสนอ จึงชอบด้วยกฎหมาย และการที่ผู้ถูกฟ้องคดีที่ ๓ (คณะกรรมการพิทักษ์ระบบคุณธรรม) มีคำวินิจฉัยยกคำร้องทุกข์ของผู้ฟ้องคดีจึงชอบด้วยกฎหมายเช่นเดียวกัน